Здравствуйте, Inversion, Вы писали:

I>Нужно хоть каким-то способом убрать WH_CBT/WH_CALLWNDPROC хуки из подобных cmd-процессов при завершении программы. Метод может быть самый фантастический, лишь бы работал и не был ощутим по производительности (даже те таймеры, которые я пробовал не были заметны в системе).

Могу дать такую наводку — хуки снимаются где-то внутри GetMessage/PostMessage, и до тех пор, пока эти функции не будут вызваны, он не будет выгружен. Возможно что cmd.exe как-то виснет в ожидании чего-то, или у него просто нет нормального цикла обработки сообщений. Может поможет его потоку отправить PostThreadMessage, или завести свой и там вызвать GetMessage?